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首先，多功能酶標分析儀需要放在一個干凈、平整的工作臺上，做到防塵、防潮、防曬、防震、防撞。在使用儀器時使用符合儀器需要的電壓，電壓不穩定的則要使用穩壓器，使輸入酶標分析儀的電壓保持穩定。對于多功能酶標分析儀使用方法通常分為4個步驟：
1、將儀器后部的電源開關打開，顯示自檢，等候1分鐘預熱。
2、將打印機開關打開，打印機自檢，放置打印紙。
3、進行檢測。
4、檢測完畢后，關閉打印機電源開關及儀器電源開關，并記錄多功能酶標分析儀使用記錄。
不同品牌型號的多功能酶標分析儀在具體使用上會存在一些差異，使用者應當嚴格遵守酶標分析儀廠家的操作規程進行使用，如儀器出現故障，應馬上退出檢測狀態，立即向保管人員或科室負責人報告，查明原因，及時處理，不得擅自修理，并做好使用和故障情況登記及實驗記錄。
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